DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 ‘A’, ‘C’, ‘G’ 和 ‘T’.。
- 例如,”ACGAATTCCG” 是一个 DNA序列 。
在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。
给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。
示例 1:
输入:s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出:["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]
示例 2:
输入:s = "AAAAAAAAAAAAA"
输出:["AAAAAAAAAA"]
提示:
- 0 <= s.length <= 105
- s[i]==’A’、’C’、’G’ or ‘T’
解题:
func findRepeatedDnaSequences(s string) []string {
l := len(s)
var r []string
if l < 10 {
return r
}
h := make(map[string]int)
for i := 0; i <= l-10; i++ {
tmp := s[i : i+10]
if h[tmp] == 1 {
r = append(r, tmp)
}
h[tmp]++
}
return r
}
官方解答:
1.哈希表
const L = 10
func findRepeatedDnaSequences(s string) (ans []string) {
cnt := map[string]int{}
for i := 0; i <= len(s)-L; i++ {
sub := s[i : i+L]
cnt[sub]++
if cnt[sub] == 2 {
ans = append(ans, sub)
}
}
return
}
2.哈希表 + 滑动窗口 + 位运算
const L = 10
var bin = map[byte]int{'A': 0, 'C': 1, 'G': 2, 'T': 3}
func findRepeatedDnaSequences(s string) (ans []string) {
n := len(s)
if n <= L {
return
}
x := 0
for _, ch := range s[:L-1] {
x = x<<2 | bin[byte(ch)]
}
cnt := map[int]int{}
for i := 0; i <= n-L; i++ {
x = (x<<2 | bin[s[i+L-1]]) & (1<<(L*2) - 1)
cnt[x]++
if cnt[x] == 2 {
ans = append(ans, s[i:i+L])
}
}
return
}