LeetCode 187 重复的DNA序列

DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 ‘A’, ‘C’, ‘G’ 和 ‘T’.。

  • 例如,”ACGAATTCCG” 是一个 DNA序列 。

在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。

给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。

示例 1:

输入:s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出:["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]

示例 2:

输入:s = "AAAAAAAAAAAAA"
输出:["AAAAAAAAAA"]

提示:

  • 0 <= s.length <= 105
  • s[i]==’A’、’C’、’G’ or ‘T’

解题:

func findRepeatedDnaSequences(s string) []string {
	l := len(s)
	var r []string
	if l < 10 {
		return r
	}
	h := make(map[string]int)
	for i := 0; i <= l-10; i++ {
		tmp := s[i : i+10]
		if h[tmp] == 1 {
			r = append(r, tmp)
		}
		h[tmp]++
	}
	return r
}

官方解答:

1.哈希表

const L = 10

func findRepeatedDnaSequences(s string) (ans []string) {
	cnt := map[string]int{}
	for i := 0; i <= len(s)-L; i++ {
		sub := s[i : i+L]
		cnt[sub]++
		if cnt[sub] == 2 {
			ans = append(ans, sub)
		}
	}
	return
}

2.哈希表 + 滑动窗口 + 位运算

const L = 10

var bin = map[byte]int{'A': 0, 'C': 1, 'G': 2, 'T': 3}

func findRepeatedDnaSequences(s string) (ans []string) {
	n := len(s)
	if n <= L {
		return
	}
	x := 0
	for _, ch := range s[:L-1] {
		x = x<<2 | bin[byte(ch)]
	}
	cnt := map[int]int{}
	for i := 0; i <= n-L; i++ {
		x = (x<<2 | bin[s[i+L-1]]) & (1<<(L*2) - 1)
		cnt[x]++
		if cnt[x] == 2 {
			ans = append(ans, s[i:i+L])
		}
	}
	return
}

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注